@fuf3,
2003 - начальное повествование идет примерно по манге, но потом в один момент сворачивает в оригинальном направлении и имеет другую концовку, как и значительные отличия с первоисточником, включая мелкие детали.
2009 - спидран начальных глав манги и затем полностью идущий по манге, включая концовку.
Оба алхимика разительно отличаются, хотя имеют одних и тех же гг братьев и тематику с алхимией.

Альтернативное окончание. В создании сюжета и там и там участвовала одна и та же автор. В начале события те же самые, а потом расходится. Вы можете посмотреть мой отзыв, там подробно без спойлеров расписано.

Какие возникают проблемы, если вначале смотреть Братство? Первые 7 томов манги адаптированы очень сжато, по сути как рекап.
Причем не только по сравнению с оригинальной адаптацией, но и по сравнению с остальными томами в Братстве. В результате зрители в массовом порядке жалуются, что ничего не понятно и смотреть не интересно. Некоторые в этот момент бросают.

Почему все-таки не стоит смотреть 1-34 эпизоды оригинальной адаптации, а затем Братство начиная с 14 эпизода? Если с точки зрения сюжета не принципиально, то сама адаптация сделана совсем по-разному, переключаться будет тяжело. Тем более, что после первых 34 эпизодов оригинальной адаптации останется всего 17 эпизодов и фильм. Проще и интереснее будет досмотреть до конца. Ну и первые эпизоды Братства потом будет смотреть легко именно как рекап. Если появится такое желание.